ImageMagickで半透明の四角形を描画するには、以下のコマンドを実行します。
rem 環境によって変えてね
set im=C:\Progra~1\ImageMagick-6.3.0-Q16
%im%\convert.exe -size 200x150 sample1.jpg -draw "fill #000000 fill-opacity 0.5 rectangle 30,30 70,70 fill #0000ff fill-opacity 0.3 rectangle 60,60 100,100" sample11.jpg
元画像(sample1.jpg)
半透明の四角形を描画した後(sample11.jpg)